En mars 1968, alors que les premières tensions de la crise future se font sentir, l'INED publie le premier numéro de sa nouvelle revue mensuelle, Population et Sociétés. La crise n'interrompra pas la publication.

Pourtant, les troubles n'épargnent pas l'Institut où s'opposent deux générations d'inédiens. De mai à juin 1968, une Assemblée générale se réunit dans les locaux de l'INED et organise des débats. Un Comité provisoire de gestion se crée. La crise aboutit deux ans plus tard à une reprise en main de l'Institut par un administrateur provisoire, Jean Trillat. Il assure l'interim laissé par le départ de Jean Bourgeois-Pichat.